Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zpr1Q62384 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zpr1Q62384 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Zpr1Q62384 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms