Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Sall3Q62255 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sall3Q62255 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms