Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SnrpcQ62241 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms