Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pcbp2Q61990 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pcbp2Q61990 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms