Protein–RNA interactions for Protein: Q61851

Fgfr3, Fibroblast growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr3Q61851 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgfr3Q61851 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgfr3Q61851 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgfr3Q61851 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms