Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrn1Q61809 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Lrrn1Q61809 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Lrrn1Q61809 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrn1Q61809 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.2 ms