Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AlcamQ61490 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AlcamQ61490 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AlcamQ61490 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms