Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccna1Q61456 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms