Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnna2Q61301 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms