Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AcanQ61282 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AcanQ61282 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AcanQ61282 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AcanQ61282 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AcanQ61282 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AcanQ61282 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AcanQ61282 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AcanQ61282 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AcanQ61282 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AcanQ61282 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AcanQ61282 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AcanQ61282 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AcanQ61282 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms