Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamb3Q61087 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamb3Q61087 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms