Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn11Q60771 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn11Q60771 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cldn11Q60771 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms