Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stxbp3Q60770 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp3Q60770 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms