Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyb561Q60720 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyb561Q60720 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyb561Q60720 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyb561Q60720 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyb561Q60720 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms