Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Foxd4Q60688 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms