Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp13a4Q5XF90 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms