Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdcp1Q5U462 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdcp1Q5U462 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms