Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms