Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r196Q5SVD5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms