Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AbrQ5SSL4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms