Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trdv2-2Q5R1A4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms