Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC57

Fam183b, Protein FAM183B, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam183bQ5NC57 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam183bQ5NC57 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam183bQ5NC57 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam183bQ5NC57 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms