Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp28Q5I043 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp28Q5I043 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp28Q5I043 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms