Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpm3Q5F4S9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpm3Q5F4S9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpm3Q5F4S9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms