Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AY761185Q5ERI8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AY761185Q5ERI8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AY761185Q5ERI8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms