Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CenpjQ569L8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CenpjQ569L8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpjQ569L8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CenpjQ569L8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms