Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Khdc1cQ4KL78 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms