Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SvipQ3UZP4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SvipQ3UZP4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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