Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defb48Q3UW22 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defb48Q3UW22 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Defb48Q3UW22 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Defb48Q3UW22 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Defb48Q3UW22 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms