Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
B230104I21RikQ3USW4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
B230104I21RikQ3USW4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms