Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mindy4Q3UQI9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy4Q3UQI9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms