Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Upf3bQ3ULL6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upf3bQ3ULL6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms