Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Zswim8Q3UHH1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Zswim8Q3UHH1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms