Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Parp8Q3UD82 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms