Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf180Q3U827 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf180Q3U827 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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