Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc9Q3U0M1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc9Q3U0M1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms