Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hhla1Q3TYV2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hhla1Q3TYV2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 538.7 ms