Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp13a5Q3TYU2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp13a5Q3TYU2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp13a5Q3TYU2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms