Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21440Q3TTD8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms