Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc69Q3TCJ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc69Q3TCJ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms