Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd8Q3TA59 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms