Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccbe1Q3MI99 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccbe1Q3MI99 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms