Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpusd2Q149F1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpusd2Q149F1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpusd2Q149F1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
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