Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r181Q0P547 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r181Q0P547 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms