Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q08AU9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q08AU9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q08AU9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q08AU9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q08AU9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q08AU9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q08AU9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q08AU9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q08AU9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q08AU9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q08AU9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q08AU9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q08AU9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q08AU9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q08AU9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q08AU9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q08AU9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q08AU9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q08AU9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q08AU9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q08AU9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q08AU9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q08AU9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q08AU9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q08AU9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q08AU9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q08AU9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q08AU9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q08AU9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q08AU9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q08AU9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q08AU9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q08AU9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q08AU9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q08AU9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q08AU9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q08AU9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q08AU9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q08AU9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q08AU9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q08AU9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q08AU9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q08AU9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q08AU9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q08AU9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q08AU9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q08AU9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q08AU9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms