Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F13bQ07968 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F13bQ07968 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F13bQ07968 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F13bQ07968 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F13bQ07968 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F13bQ07968 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms