Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col9a2Q07643 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a2Q07643 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms