Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NrepQ07475 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NrepQ07475 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms