Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cab39Q06138 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cab39Q06138 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms