Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sox8Q04886 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox8Q04886 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms